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＜紀要論文＞
Genetic diversity in Thai strains of Erwinia carotovora subsp. carotovora based on ERIC profiles and RFLP of a pel gene

作成者
作成者名
Seo, Sang-Tae
所属機関
所属機関名
Laboratory of Plant Pathology, Department of Plant Pathology and Pesticide Science, Graduate School of Bioresource and Bioenvironment Sciences, Kyushu University
著者識別子
100021917
作成者名
Furuya, Naruto
古屋, 成人
所属機関
所属機関名
Laboratory of Plant Pathology, Division of Plant Pathology and Pesticide Science, Department of Applied Genetics and Pest Management, Kyushu University
九州大学大学院農学研究院・生物資源環境科学府生物資源開発管理学部門植物保護防疫学講座
作成者名
Takanami, Yoichi
髙浪, 洋一
所属機関
所属機関名
Laboratory of Plant Pathology, Division of Plant Pathology and Pesticide Science, Department of Applied Genetics and Pest Management, Kyushu University
九州大学大学院農学研究院・生物資源環境科学府生物資源開発管理学部門植物保護防疫学講座
本文言語
英語
出版者
Kyushu University
九州大学農学部
発行日
2000-11
収録物名
九州大学大学院農学研究院紀要
巻
45
号
1
開始ページ
15
終了ページ
19
出版タイプ
Version of Record
アクセス権
open access
Crossref DOI
https://doi.org/10.5109/24352
関連DOI
九州大学農学部紀要 || 45(1) || p15-19
Journal of the Faculty of Agriculture, Kyushu University || 45(1) || p15-19
http://www.agr.kyushu-u.ac.jp/
関連URI
九州大学農学部紀要 || 45(1) || p15-19
Journal of the Faculty of Agriculture, Kyushu University || 45(1) || p15-19
http://www.agr.kyushu-u.ac.jp/
関連情報
九州大学農学部紀要 || 45(1) || p15-19
Journal of the Faculty of Agriculture, Kyushu University || 45(1) || p15-19
http://www.agr.kyushu-u.ac.jp/

本文ファイル

pdf p015 pdf 1.23 MB 492  

詳細

PISSN
0023-6152
NCID
AA00697606
レコードID
24352
査読有無
査読無
主題
Enterobacterial repentitive intergenic consensus (ERIC)
Restriction fragment length polymorphism (RFLP)
Genetic diversity
ISSN
0023-6152
NCID
AA00697606
注記
Molecular fingerprinting techniques of enterobacterial repetitive intergenic consensus （ERIC） and restriction fragment length polymorphism （RFLP） of a pel gene were　applied to determine genetic diversity in Thai strains of Erwinia carotovora subsp. carotovora. ERIC fingerprinting revealed a greater genotypic diversity with 10 PCR groups in 22 Thai strains. When PCR for the pel gene was carried out using the four subspecies atroseptica, carotovora, betavasculorum and wasabiae, no PCR products were obtained in　the case of betavasculorum. RFLP analysis with Sau3A was undertaken for the amplified fragments. Digestion patterns of 22 Thai strains were divided into two groups. ERIC group 1 and RFLP group 2 were composed of biovar D that were isolated from chinease cabbage, coriander and sweet pepper. The genetic diversity of E. carotovora subsp. carotovora appears to be related to their host plants and biovars in considering ERIC and RFLP data. These results indicate that ERIC and RFLP axalysis will be useful as benchmarks for genetic characterization of E. carotovora at subspecies and infraspecific level.
登録日 2012.08.02
更新日 2022.11.11

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