Structural basis for the recognition of human hemoglobin by the heme-acquisition protein Shr from Streptococcus pyogenes - 九大コレクション

＜学術雑誌論文＞
Structural basis for the recognition of human hemoglobin by the heme-acquisition protein Shr from Streptococcus pyogenes

作成者	著者識別子 100019936 0000-0001-6911-360X 作成者名 Senoo, Akinobu 妹尾, 暁暢セノオ, アキノブ所属機関所属機関名 Laboratory of Protein Drug Discovery, Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Kyushu University 九州大学大学院薬学研究院臨床薬学部門蛋白質創薬学分野所属機関所属機関名 Department of Chemistry and Biotechnology, School of Engineering, The University of Tokyo 東京大学
	作成者名 Hoshino, Masato ホシノ, マサト所属機関所属機関名 Department of Bioengineering, School of Engineering, The University of Tokyo 東京大学大学院工学系研究科バイオエンジニアリング専攻
	作成者名 Shiomi, Toshiki 塩見, 敏生シオミ, トシキ所属機関所属機関名 Laboratory of Protein Drug Discovery, Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Kyushu University 九州大学大学院薬学府臨床薬学専攻蛋白質創薬学分野
	著者識別子 80784511 作成者名 Nakakido, Makoto 中木戸, 誠ナカキド, マコト所属機関所属機関名 Department of Bioengineering, School of Engineering, The University of Tokyo 東京大学大学院工学系研究科バイオエンジニアリング専攻
	著者識別子 30550248 0000-0002-0794-3963 作成者名 Nagatoishi, Satoru 長門石, 曉ナガトイシ, サトル所属機関所属機関名 Medical Device Development and Regulation Research Center, School of Engineering, The University of Tokyo 東京大学大学院工学系研究科医療福祉工学開発評価研究センター
	著者識別子 60756732 0000-0003-2390-4785 作成者名 Kuroda, Daisuke 黒田, 大祐クロダ, ダイスケ所属機関所属機関名 Research Center for Drug and Vaccine Development, National Institute of Infectious Diseases 国立感染症研究所治療薬・ワクチン開発研究センター
	著者識別子 70294113 作成者名 Nakagawa, Ichiro 中川, 一路ナカガワ, イチロ所属機関所属機関名 Department of Microbiology, Graduate School of Medicine, Kyoto University 京都大学
	著者識別子 00336588 作成者名 Tame, R.H. Jeremy テイム, ジェレミー所属機関所属機関名 Drug Design Laboratory, Graduate School of Medical Life Science, Yokohama City University 横浜市立大学生命医科学研究科
	著者識別子 100019852 0000-0001-5568-2369 作成者名 Caaveiro, M.M. Jose カアベイロ, ホセ所属機関所属機関名 Laboratory of Protein Drug Discovery, Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Kyushu University 九州大学大学院薬学研究院臨床薬学部門蛋白質創薬学分野所属機関所属機関名 Department of Bioengineering, School of Engineering, The University of Tokyo 東京大学大学院工学系研究科バイオエンジニアリング専攻
	作成者名 Tsumoto, Kouhei 津本, 浩平ツモト, コウヘイ所属機関所属機関名 Department of Chemistry and Biotechnology, School of Engineering, The University of Tokyo 東京大学所属機関所属機関名 Department of Bioengineering, School of Engineering, The University of Tokyo 東京大学大学院工学系研究科バイオエンジニアリング専攻所属機関所属機関名 The Institute of Medical Sciences, The University of Tokyo 東京大学医科学研究所
本文言語	英語
出版者	Springer
発行日	2024-03-05
収録物名	Scientific Reports
巻	14
開始ページ	5374
出版タイプ	Version of Record
アクセス権	open access
権利関係	© The Author(s) 2024
権利関係	Creative Commons Attribution 4.0 International
関連DOI	以下と同一 https://doi.org/10.1038/s41598-024-55734-x
関連URI
関連HDL
概要	In Gram-positive bacteria, sophisticated machineries to acquire the heme group of hemoglobin (Hb) have evolved to extract the precious iron atom contained in it. In the human pathogen Streptococcus py...ogenes, the Shr protein is a key component of this machinery. Herein we present the crystal structure of hemoglobin-interacting domain 2 (HID2) of Shr bound to Hb. HID2 interacts with both, the protein and heme portions of Hb, explaining the specificity of HID2 for the heme-bound form of Hb, but not its heme-depleted form. Further mutational analysis shows little tolerance of HID2 to interfacial mutations, suggesting that its interaction surface with Hb could be a suitable candidate to develop efficient inhibitors abrogating the binding of Shr to Hb.続きを見る

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ファイル	ファイルタイプ	サイズ	閲覧回数	説明
7343671	pdf	1.94 MB	19

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EISSN	2045-2322
レコードID	7343671
主題	Hemoglobin
	Streptococcus pyogenes
	Protein–protein interaction
	Heme
	Host–pathogen interaction
	X-ray crystallography
	Surface plasmon resonance
	MD simulations
	Heme acquisition
	Biochemistry
	Biophysics
	Drug discovery
	Microbiology
	Pathogens
	Permeation and transport
	Structural biology
	Target identification
助成情報	助成機関名 Japan Society for the Promotion of Science 日本学術振興会研究課題番号 JP16H02420 研究課題名 Screening and design of ligands regulating the process of protein-protein interactions based on biophysical approaches 物理化学的理解に基づく蛋白質間相互作用プロセス制御剤の探索と設計
	助成機関名 Japan Society for the Promotion of Science 日本学術振興会研究課題番号 JP19H05766 研究課題名 Development of molecular recognition elements for understanding and regulation of biometal dynamics 生命金属動態の理解と制御のための分子認識素子の開発
	助成機関名 Japan Society for the Promotion of Science 日本学術振興会研究課題番号 JP20H02531 研究課題名 Elucidation and Control of Local Fractions in Protein Engineering 蛋白質エンジニアリングにおけるローカルフラクチュエーションの解明とその制御
	助成機関名 Japan Agency for Medical Research and Development 日本医療研究開発機構研究課題番号 JP22am0101094
	助成機関名 Japan Agency for Medical Research and Development 日本医療研究開発機構研究課題番号 JP19fm0208030
	助成機関名 Japan Agency for Medical Research and Development 日本医療研究開発機構研究課題番号 JP20fk0108073
	助成機関名 Japan Agency for Medical Research and Development 日本医療研究開発機構研究課題番号 JP23ama121031
登録日	2025.04.07
更新日	2025.04.10

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